Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc114Q3UX62 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc114Q3UX62 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms