Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWZ0

Trim75, Tripartite motif-containing protein 75, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim75Q3UWZ0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim75Q3UWZ0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms