Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms