Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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