Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms