Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm648Q3UJ22 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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