Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms