Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rnf180Q3U827 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rnf180Q3U827 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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