Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms