Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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