Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms