Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms