Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms