Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0X8

Cd96, T-cell surface protein tactile, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd96Q3U0X8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd96Q3U0X8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd96Q3U0X8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd96Q3U0X8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd96Q3U0X8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd96Q3U0X8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd96Q3U0X8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd96Q3U0X8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd96Q3U0X8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd96Q3U0X8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd96Q3U0X8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd96Q3U0X8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd96Q3U0X8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms