Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms