Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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