Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms