Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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