Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trappc13Q3TIR1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trappc13Q3TIR1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Trappc13Q3TIR1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trappc13Q3TIR1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trappc13Q3TIR1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trappc13Q3TIR1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trappc13Q3TIR1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trappc13Q3TIR1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trappc13Q3TIR1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trappc13Q3TIR1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trappc13Q3TIR1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms