Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sppl2bQ3TD49 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms