Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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