Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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