Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms