Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms