Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam178bQ24JP3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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