Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Traf3ip1Q149C2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Traf3ip1Q149C2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Traf3ip1Q149C2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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