Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.6 ms