Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Itgb8Q0VBD0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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