Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms