Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn2bQ0KL01 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms