Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms