Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms