Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms