Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms