Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms