Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms