Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nfe2Q07279 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms