Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Aplp2Q06335 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aplp2Q06335 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms