Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Caprin2Q05A80 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms