Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms