Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms