Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms