Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms