Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Top1Q04750 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms