Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RelaQ04207 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms