Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms