Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms