Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms