Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms