Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms